Cells
02 \ 细胞收集指南
转录组
一、基因芯片
1. RNA
1.1. 细胞培养结束后,去除培养液;
1.2. 加入适量的 PBS 缓冲液冲洗一次,彻底去除 PBS 缓冲液;
1.3. 按每 10 cm2 (相当于六孔板一个孔或 35mm 直径培养皿) 细胞加 1mL TRIzol (悬
浮细胞以每 5*106 个细胞加入 1mL TRIzol)试剂的比例加入 TRIzol 试剂;
1.4. 使用玻璃滴管(或移液器Tip头)反复吹打细胞,直至看不见成团的细胞块,使之
充分溶解于 TRIzol 中形成清亮不粘稠的液体;
1.5. 将 TRIzol 液体全部转移到 RNase-free 的试管中;
1.6. 放入-80℃冰箱中保存。
2. MiRNA
2.1. 贴壁细胞培养诱导结束后,去除培养液;
2.2. 加入适量的 PBS 缓冲液冲洗一次,彻底去除 PBS 缓冲液;
2.3. 按每 105 - 107的细胞加入 600μl Lysis/Binding Solution;
2.4. 使用移液器 Tip 头反复吹打细胞,直至看不见成团的细胞块, 使之充分溶解于裂
解液中形成清亮不粘稠的液体;
2.5. 将液体全部转移到 RNase-free 的试管中;
2.6. 放入-80℃冰箱中保存。
二、RNA-seq
1. 细胞培养结束后,去除培养液;
2. 加入适量的 PBS 缓冲液冲洗一次,彻底去除 PBS 缓冲液;
3. 按每 10 cm2 (相当于六孔板一个孔或 35mm 直径培养皿) 细胞加 1mL TRIzol (悬
浮细胞以每 5*106 个细胞加入1mL TRIzol)试剂的比例加入 TRIzol 试剂;
4. 使用玻璃滴管(或移液器 Tip 头)反复吹打细胞,直至看不见成团的细胞块,使之
充分溶解于 TRIzol 中形成清亮不粘稠的液体;
5. 将 TRIzol 液体全部转移到 RNase-free 的试管中;
6. 放入-80℃冰箱中保存。
三、RIP-seq/qPCR
提供1E7-2E7细胞
收样标准(贴壁细胞)
1) 弃掉培养液,并将培养皿倒置于吸水纸上吸干培养液
2) 加入4℃预冷的PBS,平放轻轻摇动1分钟洗涤细胞,然后弃去PBS。 重复以上操作两次以洗去培养液。
3) 将培养皿置于冰上。向培养皿内加入4℃预冷的PBS。用干净的细胞刮棒将细胞刮于培养皿的一侧(动作要快),冰上斜置培养皿,使得缓冲液流向一侧。移液管吸取溶解产物至预冷的离心管内。1000g,10分钟离心,去掉上清。
4) 液氮速冻,-80℃保存,干冰送样
收样标准(悬浮细胞)
1) 1000g离心10分钟收获细胞,弃上清。
2) 用预冷的PBS小心洗涤片状沉淀物2次,置于冰上,去上清。
3) 液氮速冻,-80℃保存,干冰寄送